Biologie computationnelle & modélisation de dynamique moléculaire

Cette thématique à l'interface des mathématiques, de l'informatique, de la physique et de la biologie porte sur la modélisation et la simulation pour des problèmes issus de la biologie.

Référents scientifiques

Coordinateur : Luba Tchertanov

Responsables scientifiques :

Luba Tchertanov
Alain Trouvé

Chiffres clés

0 post-doctorants -- 2 doctorants -- 3 stagiaires

8 thèses soutenues

Présentation de la thématique

Ces recherches en biologie cellulaire ou en oncologie sont interdisciplinaires à l'interface des mathématiques, de l'informatique, de la physique et de la biologie. Elles portent sur la caractérisation de biomolécules qui sont des cibles thérapeutiques valides et inédites. Les chercheurs étudient, au niveau atomistique, les propriétés structurales et dynamiques des biomolécules, représentées sous forme de modèles 3D numériques, et cherchent les relations entre leurs propriétés et la fonction biologique et/ou le dysfonctionnement menant à des pathologies graves.

Axes de recherche développés

Modélisation/Simulation et Biologie/Clinique
Modélisation/Simulation et Mathématiques
Récepteurs Tyrosine Kinases et Cancer

Mots clés

Modélisation 3D ; Simulation de dynamique moléculaire ; Reconnaissance et affinité ; Protéines et complexes moléculaires ; Désordre intrinsèque et transition ; Régulation allostérique ; Mutation et cancer ; Mutation et maladies neurodégénératives ; Résistance médicamenteuse ; Modèles stochastique ; Machine learning.

Applications

Ces recherches trouvent des applications principalement dans le domaine de la santé. Un tel niveau de caractérisation permet en effet de comprendre les effets liés aux processus moléculaires anormaux associés à des maladies graves (cancers, maladies sanguines, inflammatoires et neurodégénératives...) et de fournir de nouvelles cibles pour le développement de nouvelles molécules (inhibiteurs/modulateurs) afin de contrôler ces processus.